苗期发病首先会在茎基部形成暗绿色的水渍状病斑，之后植株会迅速地因褐腐缢缩而猝倒，有时茎基部会呈黑褐色，严重时幼苗会枯萎死亡；成株期若叶片感病则会出现病斑，病斑呈圆形或近圆形，边缘为黄绿色，中央为暗褐色；椒果发病多从蒂部开始，病斑为水渍状，暗绿色，扩大后可遍及整个椒果，潮湿时椒果表面会产生霉层。

辣（甜）椒疫病主要为害叶片、果实和茎，特别是茎基部最易发生。幼苗期发病，多从茎基部开始染病，病部出现水渍状软腐，病斑暗绿色，病部以上倒伏。成株染病，叶片上出现暗绿色圆形病斑，边缘不明显，潮湿时，其上可出现白色霉状物，病斑扩展迅速，叶片大部软腐，易脱落，干后成淡褐色。茎部染病，出现暗褐色条状病斑，边缘不明显，条斑以上枝叶枯萎，病斑呈褐色软腐，潮湿时斑上出现白色霉层。果实染病，病斑呈水渍状暗绿色软腐，边缘不明显，潮湿时，病部扩展迅速，可全果软腐，果上密生白色霉状物，干燥后变淡褐色、枯干。

苗期发病首先会在茎基部形成暗绿色的水渍状病斑，之后植株会迅速地因褐腐缢缩而猝倒，有时茎基部会呈黑褐色，严重时幼苗会枯萎死亡；成株期若叶片感病则会出现病斑，病斑呈圆形或近圆形，边缘为黄绿色，中央为暗褐色。

辣（甜）椒疫病主要为害叶片、果实和茎，特别是茎基部最易发生。幼苗期发病，多从茎基部开始染病，病部出现水渍状软腐，病斑暗绿色，病部以上倒伏。

疫病的病原菌的卵孢子可存活3年以上，主要以卵孢子在土壤中和病残体上越冬，可度过不种植寄主作物的季节。在适宜的温度和湿度条件下，卵孢子开始萌发，产生游动孢子，侵入辣椒的根部、茎基部、叶部。在辣椒生长期间，病株陆续产生孢子囊和游动孢子，主要随灌溉的水和雨扩散传播，发生多次再侵染。病原菌还可通过风雨吹溅和农事操作而传染,引起叶、枝、果发病。田间最初仅有少数植株发病，但也形成传病中心，很快向周围扩散,侵染邻近植株。根据各地田间调查证明，由1个病株向周围扩展，10天内发病面积可达到12平方米，20天内即可达到45平方米。如在适宜条件下，由开始发病到全田发病只需7天左右。