病原借雨水、灌溉水传播。苗床或营养钵积水,长期阴雨、光照不足或低温高湿立枯病发病重;黄瓜立枯病多在床温较高或育苗后期发生。

病菌以菌丝体或菌核在土壤中或病残组织上越冬，腐生性较强，在土壤中可存活2-3年。病菌通常从伤口或表皮直接侵入幼茎，引起根部发病，借雨水或灌溉水传播。

黄瓜立枯病是由丝核属真菌和半知菌亚门侵染所致，通过灌溉、农具等传播。