基层审计机关对工程跟踪审计成效是任何审计方法都比不了的，因为他是和经济运行同步进行的，直言地说就是项目每进行一步都审计监督，由此而达到项目资金总是按照拟定的轨迹运转，基本没有偏颇、瑕疵出现，例如：
设计概算的跟踪审计，可以借鉴以往的教训宽打窄用、钓鱼项目，施工中途缺乏资金而停工待料；
项目批复过程的审计，有的批复不按常规办事，将总指标不变的情况下，加大其他投资，相应缩小工程项目投资，例如：总项目中的管理费、设计负、拆迁费无限扩大，用到工程项目资金捉襟见肘，造成人为资金缺口，结果建设单位将所谓的结余资金挪作他用；
施工过程的审计，他可以杜绝别有用心的人从中作梗，严格按照设计施工，确保工期、确保质量；
工程结算工程审计，由于采用跟踪审计方法，项目实施过程中人为造成的种种不利因素随时随地都消除，因此审计机关跟踪审计大大提高基层成效。