有区别。

因为贝果是烘烤面包，冷冻后再解冻热食会导致面包组织受损，口感会变得不松软，而常温下保存的贝果则能保持松软口感。

同时，常温下保存的贝果也不易受到空气和水汽的影响，不会产生冰冻时可能出现的水垢和脆性，口感更好。

因此，建议尽量在常温下保存贝果，以保证最好的口感体验。