苹果炭疽病以菌丝在病果、果台、干枝、僵果及被潜皮蛾为害枝条上越冬。春季产生分生孢子，借风雨、昆虫传播。分生孢子产生芽管直接侵入表皮，也可通过皮孔、伤口侵入果实。