从自然角度说,南疆生态系统较脆弱,破坏后恢复难.再有多沙尘天气,不利于火车的运行及铁路的维护.塔克拉玛干等沙漠的分布也对铁路选线产生影响.昼夜温差大对铁路的寿命产生不利影响.有一点好处就是盆地内部地势平坦,地质条件单一,有利于修建.从社会角度说,城镇的分布,绿洲及农业区的分布,科技要求和修建成本都对铁路产生影响