入境货物通关单是在货物申报时出具，提供给货主及海关，用于办理通关手续，目前已经逐步电子化、无纸化。检验检疫证明是在货物通关后、完成检验检疫手续后出具，提供给货主，证明业经检验检疫，以及写明检验检疫结果。